Projekat “Čista rijeka Miljacka“ odvijat će se u više faza. Prva faza započet će u 2022. godini  i odnosit će se na tekuće i investiciono održavanje uređenih korita rijeke Miljacke i njenih pritoka, izradu cjelovitog projekta sanacije (prioritetno na dionici od Bembaše do Mosta Suade i Olge), nastavak istražnih radnji i izrade projekata sanacije zacijevljenih dijelova pritoka rijeke Miljacke, nastavak realizacije započetih projekata sanacije na vodotocima Bistričkog i Ramića potoka te Koševskog potoka. Projekat podrazumijeva i traženje i predlaganje rješavanja odvodnje tehničke i fekalne vode koja se ulijeva u ove vodotoke, kao i vode iz ispusta sa kolovoza saobraćajnica.  Također, projektom se želi podići i svijest javnosti o važnosti zaštite okoliša, prirodnih resursa i zaštite ljudskog zdravlja, te usmjeriti građane i građanke da borave pored čiste i zdrave otvorene vodene površine.

Podsjećamo, projekat “Čista rijeka Miljacka” je skraćeni naziv za širi projekat “Čiste vode cijele sarajevske kotline”. Njegov cilj je poboljšanje i očuvanje kvalitete vode u vodotocima, zaštita resursa i ekosistema slivnih područja rijeka: Miljacke, Željeznice, Zujevine, Dobrinje i neposrednog sliva rijeke Bosne do vodomjerne stanice u Reljevu. 

Krajem 2008. godine potpisan je protokol o saradnji radi realizacije ovog projekta između Sarajevske regionalne razvojne agencije (SERDA), tadašnjih čelnika i čelnica gradova Sarajevo i Istočno Sarajevo, općina Centar, Novo Sarajevo, Stari Grad, Novi Grad, Ilidža i Pale, te nadležnih ministarstava. U ovoj prvoj fazi, potpisnici i potpisnice protokola osigurale su 531.000 KM, od čega SERDA 200.000 KM, a gradovi Sarajevo i Istočno Sarajevo sa po 50.000 KM.

Prve aktivnosti na realizaciji projekta pokrenute su 2010. godine, kada je započeo rad na studiji pod nazivom “Projekt Čista rijeka Miljacka”, koja je i usvojena 2012. godine. Potom je, krajem 2017. godine, pokrenuta inicijativa Fonda za zaštitu okoliša Federacije BiH i Fonda za zaštitu životne sredine i energetsku efikasnost Republike Srpske u svrhu zajedničkog učešća u pripremi i sufinansiranju aktivnosti projekta. Sredinom 2018. godine, povodom obilježavanja Svjetskog dana okoliša u Bosni i Hercegovini, u Sarajevu je potpisana inicijativa za aktiviranje ovog projekta kao prvog zajedničkog projekta ovog tipa između Fonda za zaštitu okoliša Federacije BiH i Fonda za zaštitu okoliša i energetsku efikasnost Republike Srpske.